Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN8Q9UBY8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms