Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC4Q9UBN4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms