Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP2BPQ9P2M1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP2BPQ9P2M1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms