Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP36Q9P275 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP36Q9P275 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms