Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms