Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMOD2Q9NZR1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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