Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDE1Q9NZC3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDE1Q9NZC3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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