Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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