Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR3EQ9NVU0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms