Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTLC3Q9NUV7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms