Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms