Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A13Q9NSD5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms