Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRT84Q9NSB2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms