Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRN4Q9NRL3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRN4Q9NRL3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms