Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TIMMDC1Q9NPL8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms