Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms