Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD3Q9H7E2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms