Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms