Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PHACTR1Q9C0D0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms