Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRCC1Q9C099 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms