Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAPERQ9BY12 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms