Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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