Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms