Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BBS2Q9BXC9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms