Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP1Q9BWH6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP1Q9BWH6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms