Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms