Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDC1Q9BTX1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms