Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TIMM29Q9BSF4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms