Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF559Q9BR84 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms