Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BPIFA3Q9BQP9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms