Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TREX2Q9BQ50 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms