Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms