Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POP1Q99575 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POP1Q99575 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POP1Q99575 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POP1Q99575 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP1Q99575 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms