Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKP4Q99569 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKP4Q99569 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms