Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LGMNQ99538 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGMNQ99538 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms