Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
RSF1Q96T23 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RSF1Q96T23 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms