Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC22A12Q96S37 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms