Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CITED4Q96RK1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms