Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms