Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EP400Q96L91 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms