Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms