Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHDQ96IW2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms