Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF183Q96D59 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms