Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD4Q96CM3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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