Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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