Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHMTQ93088 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMTQ93088 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms