Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF1Q92879 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms