Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms