Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAJA4Q8WW22 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJA4Q8WW22 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJA4Q8WW22 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJA4Q8WW22 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms