Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms